在质量认证过程中，出现问题和非合格项是难以避免的。管理者应该采取以下措施来处理这些问题和非合格项：
引入质量管理体系：建立和实施完善的质量管理体系，包括质量控制、质量保证和质量改进等方面的流程和规范。这样可以帮助管理者及时发现和解决问题，并避免非合格项的发生。
制定质量标准和规范：制定明确的质量标准和规范，确保产品或服务符合客户要求和行业标准。同时，对供应商进行评估和监控，确保其产品或服务的质量符合要求。
建立问题识别和分析机制：建立问题识别和分析机制，及时发现和记录问题，并对其进行分析和原因追溯。通过识别问题的根本原因，可以采取相应的纠正和预防措施，避免问题再次发生。
实施纠正和预防措施：一旦发现问题或非合格项，应立即采取纠正措施，及时修复和改进。同时，还应制定预防措施，防止类似问题再次发生。这可以包括培训员工、改进工艺流程、优化设备等。
进行合适的回溯和追溯：对于严重的质量问题，应进行回溯和追溯，找出问题的起因和责任方。这有助于整改和防止类似问题再次发生，并对相关责任方进行追责和管理。
与相关方进行沟通和协商：在处理质量问题和非合格项时，与相关方进行沟通和协商是非常重要的。这包括与供应商、客户和监管机构等进行沟通，共同解决问题，确保质量目标的达成。
不断改进和学习：质量管理是一个持续改进的过程。管理者应不断学习和借鉴其他企业的经验和做法，引进先进的管理理念和工具，不断提升质量管理水平。
总之，处理质量认证中的问题和非合格项需要管理者具备一定的质量管理知识和技能，并采取相应的措施和方法。通过建立良好的质量管理体系，制定明确的质量标准和规范，识别和分析问题，实施纠正和预防措施，与相关方进行沟通和协商，不断改进和学习，可以有效处理和解决质量认证中的问题和非合格项。